Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc6a20aQ8VDB9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a20aQ8VDB9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc6a20aQ8VDB9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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