Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Med17Q8VCD5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med17Q8VCD5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms