Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4B8

Nlrp3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp3Q8R4B8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp3Q8R4B8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp3Q8R4B8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp3Q8R4B8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp3Q8R4B8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp3Q8R4B8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp3Q8R4B8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp3Q8R4B8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp3Q8R4B8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp3Q8R4B8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nlrp3Q8R4B8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Nlrp3Q8R4B8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrp3Q8R4B8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nlrp3Q8R4B8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nlrp3Q8R4B8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nlrp3Q8R4B8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nlrp3Q8R4B8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp3Q8R4B8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp3Q8R4B8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp3Q8R4B8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms