Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2E3

Vmn1r36, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r36Q8R2E3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r36Q8R2E3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r36Q8R2E3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r36Q8R2E3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r36Q8R2E3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r36Q8R2E3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r36Q8R2E3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms