Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Treml1Q8K558 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Treml1Q8K558 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms