Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Hecw1Q8K4P8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Hecw1Q8K4P8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hecw1Q8K4P8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms