Protein–RNA interactions for Protein: Q8K448

Abca5, ATP-binding cassette sub-family A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca5Q8K448 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Abca5Q8K448 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Abca5Q8K448 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Abca5Q8K448 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms