Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r72Q8K3N7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r72Q8K3N7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r72Q8K3N7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r72Q8K3N7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r72Q8K3N7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r72Q8K3N7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r72Q8K3N7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r72Q8K3N7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r72Q8K3N7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r72Q8K3N7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r72Q8K3N7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r72Q8K3N7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r72Q8K3N7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r72Q8K3N7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r72Q8K3N7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn1r72Q8K3N7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r72Q8K3N7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r72Q8K3N7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r72Q8K3N7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r72Q8K3N7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r72Q8K3N7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms