Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
OptnQ8K3K8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OptnQ8K3K8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms