Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vrk3Q8K3G5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vrk3Q8K3G5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms