Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stn1Q8K2X3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stn1Q8K2X3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms