Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sde2Q8K1J5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sde2Q8K1J5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms