Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx5Q8K1E0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx5Q8K1E0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms