Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34c1Q8K193 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34c1Q8K193 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34c1Q8K193 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c1Q8K193 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c1Q8K193 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c1Q8K193 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c1Q8K193 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Cldn34c1Q8K193 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Cldn34c1Q8K193 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c1Q8K193 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c1Q8K193 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c1Q8K193 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Cldn34c1Q8K193 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c1Q8K193 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c1Q8K193 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c1Q8K193 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c1Q8K193 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c1Q8K193 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c1Q8K193 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Cldn34c1Q8K193 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34c1Q8K193 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34c1Q8K193 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34c1Q8K193 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34c1Q8K193 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Cldn34c1Q8K193 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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Cldn34c1Q8K193 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Cldn34c1Q8K193 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Cldn34c1Q8K193 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Cldn34c1Q8K193 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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