Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc47a1Q8K0H1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc47a1Q8K0H1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc47a1Q8K0H1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc47a1Q8K0H1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc47a1Q8K0H1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc47a1Q8K0H1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc47a1Q8K0H1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc47a1Q8K0H1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc47a1Q8K0H1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc47a1Q8K0H1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc47a1Q8K0H1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc47a1Q8K0H1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc47a1Q8K0H1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc47a1Q8K0H1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms