Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne5Q8JZW4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne5Q8JZW4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne5Q8JZW4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne5Q8JZW4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne5Q8JZW4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne5Q8JZW4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne5Q8JZW4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne5Q8JZW4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne5Q8JZW4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne5Q8JZW4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne5Q8JZW4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne5Q8JZW4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne5Q8JZW4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne5Q8JZW4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne5Q8JZW4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne5Q8JZW4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne5Q8JZW4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne5Q8JZW4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne5Q8JZW4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne5Q8JZW4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne5Q8JZW4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne5Q8JZW4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne5Q8JZW4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne5Q8JZW4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne5Q8JZW4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne5Q8JZW4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpne5Q8JZW4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms