Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Afg3l2Q8JZQ2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Afg3l2Q8JZQ2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Afg3l2Q8JZQ2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Afg3l2Q8JZQ2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Afg3l2Q8JZQ2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Afg3l2Q8JZQ2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Afg3l2Q8JZQ2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Afg3l2Q8JZQ2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Afg3l2Q8JZQ2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Afg3l2Q8JZQ2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Afg3l2Q8JZQ2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Afg3l2Q8JZQ2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Afg3l2Q8JZQ2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Afg3l2Q8JZQ2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Afg3l2Q8JZQ2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Afg3l2Q8JZQ2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Afg3l2Q8JZQ2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Afg3l2Q8JZQ2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Afg3l2Q8JZQ2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Afg3l2Q8JZQ2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Afg3l2Q8JZQ2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Afg3l2Q8JZQ2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Afg3l2Q8JZQ2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Afg3l2Q8JZQ2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Afg3l2Q8JZQ2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms