Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC7

Klre1, Killer cell lectin-like receptor subfamily E member 1, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klre1Q8CJC7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Klre1Q8CJC7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klre1Q8CJC7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klre1Q8CJC7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klre1Q8CJC7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klre1Q8CJC7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Klre1Q8CJC7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klre1Q8CJC7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klre1Q8CJC7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klre1Q8CJC7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klre1Q8CJC7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klre1Q8CJC7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klre1Q8CJC7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Klre1Q8CJC7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klre1Q8CJC7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klre1Q8CJC7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klre1Q8CJC7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klre1Q8CJC7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Klre1Q8CJC7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klre1Q8CJC7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klre1Q8CJC7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klre1Q8CJC7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Klre1Q8CJC7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klre1Q8CJC7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klre1Q8CJC7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Klre1Q8CJC7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Klre1Q8CJC7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klre1Q8CJC7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Klre1Q8CJC7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Klre1Q8CJC7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Klre1Q8CJC7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klre1Q8CJC7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klre1Q8CJC7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Klre1Q8CJC7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Klre1Q8CJC7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klre1Q8CJC7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Klre1Q8CJC7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klre1Q8CJC7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Klre1Q8CJC7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klre1Q8CJC7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Klre1Q8CJC7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Klre1Q8CJC7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klre1Q8CJC7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klre1Q8CJC7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klre1Q8CJC7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klre1Q8CJC7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klre1Q8CJC7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klre1Q8CJC7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klre1Q8CJC7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klre1Q8CJC7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klre1Q8CJC7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klre1Q8CJC7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klre1Q8CJC7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klre1Q8CJC7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klre1Q8CJC7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klre1Q8CJC7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klre1Q8CJC7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klre1Q8CJC7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klre1Q8CJC7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Klre1Q8CJC7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Klre1Q8CJC7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klre1Q8CJC7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klre1Q8CJC7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms