Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf628Q8CJ78 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf628Q8CJ78 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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