Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIN6

Celf3, CUGBP Elav-like family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf3Q8CIN6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Celf3Q8CIN6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Celf3Q8CIN6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Celf3Q8CIN6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Celf3Q8CIN6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Celf3Q8CIN6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Celf3Q8CIN6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Celf3Q8CIN6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Celf3Q8CIN6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Celf3Q8CIN6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Celf3Q8CIN6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Celf3Q8CIN6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Celf3Q8CIN6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Celf3Q8CIN6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Celf3Q8CIN6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Celf3Q8CIN6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Celf3Q8CIN6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Celf3Q8CIN6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Celf3Q8CIN6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Celf3Q8CIN6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Celf3Q8CIN6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Celf3Q8CIN6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Celf3Q8CIN6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Celf3Q8CIN6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Celf3Q8CIN6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Celf3Q8CIN6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Celf3Q8CIN6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Celf3Q8CIN6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Celf3Q8CIN6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Celf3Q8CIN6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Celf3Q8CIN6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Celf3Q8CIN6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms