Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Brf1Q8CFK2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Brf1Q8CFK2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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