Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx8Q8CFD4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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