Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms