Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc17Q8CE13 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc17Q8CE13 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms