Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsph6aQ8CDR2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rsph6aQ8CDR2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rsph6aQ8CDR2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms