Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc87Q8CDL9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc87Q8CDL9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms