Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CrebrfQ8CDG5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms