Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9L1

BC106179, BC106179 protein, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC106179Q8C9L1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC106179Q8C9L1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
BC106179Q8C9L1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms