Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spef2Q8C9J3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spef2Q8C9J3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms