Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8W7

A930004D18Rik, MCG147224, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A930004D18RikQ8C8W7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
A930004D18RikQ8C8W7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms