Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Bhlhe22Q8C6A8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bhlhe22Q8C6A8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms