Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpcpd1Q8C0L9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpcpd1Q8C0L9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpcpd1Q8C0L9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpcpd1Q8C0L9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpcpd1Q8C0L9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpcpd1Q8C0L9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpcpd1Q8C0L9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpcpd1Q8C0L9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpcpd1Q8C0L9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpcpd1Q8C0L9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpcpd1Q8C0L9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpcpd1Q8C0L9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpcpd1Q8C0L9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpcpd1Q8C0L9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpcpd1Q8C0L9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpcpd1Q8C0L9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpcpd1Q8C0L9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpcpd1Q8C0L9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpcpd1Q8C0L9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Gpcpd1Q8C0L9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Gpcpd1Q8C0L9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpcpd1Q8C0L9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpcpd1Q8C0L9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpcpd1Q8C0L9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpcpd1Q8C0L9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpcpd1Q8C0L9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpcpd1Q8C0L9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpcpd1Q8C0L9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpcpd1Q8C0L9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpcpd1Q8C0L9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpcpd1Q8C0L9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpcpd1Q8C0L9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpcpd1Q8C0L9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpcpd1Q8C0L9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpcpd1Q8C0L9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpcpd1Q8C0L9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms