Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctdsp2Q8BX07 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms