Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TtpaQ8BWP5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TtpaQ8BWP5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms