Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup54Q8BTS4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup54Q8BTS4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms