Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD4

Gjd4, Gap junction delta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd4Q8BSD4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjd4Q8BSD4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjd4Q8BSD4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjd4Q8BSD4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjd4Q8BSD4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjd4Q8BSD4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjd4Q8BSD4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjd4Q8BSD4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjd4Q8BSD4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjd4Q8BSD4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjd4Q8BSD4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjd4Q8BSD4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjd4Q8BSD4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjd4Q8BSD4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjd4Q8BSD4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjd4Q8BSD4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms