Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gga3Q8BMI3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gga3Q8BMI3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gga3Q8BMI3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gga3Q8BMI3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gga3Q8BMI3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms