Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG7

Rab3gap2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap2Q8BMG7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab3gap2Q8BMG7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms