Protein–RNA interactions for Protein: Q8BME9

Cbln4, Cerebellin-4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbln4Q8BME9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbln4Q8BME9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cbln4Q8BME9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbln4Q8BME9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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