Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Usp54Q8BL06 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Usp54Q8BL06 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms