Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tspan12Q8BKT6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms