Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnrc6bQ8BKI2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnrc6bQ8BKI2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms