Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pknox2Q8BG99 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pknox2Q8BG99 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pknox2Q8BG99 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pknox2Q8BG99 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pknox2Q8BG99 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pknox2Q8BG99 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pknox2Q8BG99 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pknox2Q8BG99 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pknox2Q8BG99 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pknox2Q8BG99 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pknox2Q8BG99 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pknox2Q8BG99 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pknox2Q8BG99 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pknox2Q8BG99 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pknox2Q8BG99 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pknox2Q8BG99 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pknox2Q8BG99 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms