Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG54

Sptlc3, Serine palmitoyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc3Q8BG54 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptlc3Q8BG54 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms