Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc50Q810U5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms