Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp8Q80YR6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8Q80YR6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms