Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnupnQ80W37 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms