Protein–RNA interactions for Protein: Q80V24

Vgll4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll4Q80V24 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll4Q80V24 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll4Q80V24 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll4Q80V24 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll4Q80V24 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms