Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab3gap1Q80UJ7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab3gap1Q80UJ7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab3gap1Q80UJ7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms