Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cep170bQ80U49 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cep170bQ80U49 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cep170bQ80U49 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms